MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY040

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016022	TCTGC	2	10	31	40	0 %	40 %	20 %	40 %	347626538
2	NC_016022	CGGT	2	8	119	126	0 %	25 %	50 %	25 %	347626538
3	NC_016022	TGA	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626538
4	NC_016022	GGC	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626538
5	NC_016022	AGA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347626538
6	NC_016022	ATC	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626538
7	NC_016022	ATC	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626538
8	NC_016022	TGA	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626538
9	NC_016022	AAC	2	6	478	483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347626538
10	NC_016022	GCT	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626538
11	NC_016022	TGT	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347626538
12	NC_016022	ATCA	2	8	543	550	50 %	25 %	0 %	25 %	347626538
13	NC_016022	CGT	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626538
14	NC_016022	GGT	2	6	649	654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347626538
15	NC_016022	TCG	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626538
16	NC_016022	CGC	2	6	781	786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626538
17	NC_016022	CGA	2	6	839	844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626538
18	NC_016022	CGG	2	6	847	852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626538
19	NC_016022	TAA	3	9	880	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347626538
20	NC_016022	CA	3	6	895	900	50 %	0 %	0 %	50 %	347626539
21	NC_016022	TGA	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626539
22	NC_016022	ATC	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626539
23	NC_016022	CGC	2	6	1177	1182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626539
24	NC_016022	GTC	2	6	1205	1210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626539
25	NC_016022	ATGA	2	8	1247	1254	50 %	25 %	25 %	0 %	347626539
26	NC_016022	TGA	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626539
27	NC_016022	GGTCAA	2	12	1433	1444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347626539
28	NC_016022	TC	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	347626539
29	NC_016022	TG	3	6	1576	1581	0 %	50 %	50 %	0 %	347626539
30	NC_016022	CGG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626539
31	NC_016022	AAG	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347626539
32	NC_016022	GTA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626539
33	NC_016022	ATCC	2	8	1840	1847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016022	CA	3	6	1891	1896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016022	CCG	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016022	CG	8	16	1901	1916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016022	CCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016022	TG	3	6	2003	2008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016022	CCG	2	6	2063	2068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016022	CCTTC	2	10	2091	2100	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_016022	CT	3	6	2114	2119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016022	ATC	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016022	GAA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016022	TCG	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016022	TCG	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016022	GCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016022	CCGG	2	8	2419	2426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016022	GAT	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016022	GGC	2	6	2497	2502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016022	ATC	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016022	GGC	2	6	2644	2649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016022	CCGG	2	8	2665	2672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016022	GTCTCT	2	12	2683	2694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016022	CCT	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016022	ATGG	2	8	2750	2757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016022	CAT	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016022	CT	4	8	2854	2861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016022	AGGA	2	8	2981	2988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016022	CCG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626540
60	NC_016022	CG	3	6	3024	3029	0 %	0 %	50 %	50 %	347626540
61	NC_016022	GTC	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
62	NC_016022	CGT	2	6	3069	3074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
63	NC_016022	GCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
64	NC_016022	GCG	3	9	3402	3410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
65	NC_016022	GGC	2	6	3437	3442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
66	NC_016022	GAT	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626540
67	NC_016022	GCG	3	9	3534	3542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
68	NC_016022	CGG	2	6	3565	3570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
69	NC_016022	CGG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
70	NC_016022	TGA	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626540
71	NC_016022	ATC	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
72	NC_016022	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
73	NC_016022	GAC	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626540
74	NC_016022	CT	3	6	3810	3815	0 %	50 %	0 %	50 %	347626540
75	NC_016022	GCC	2	6	3834	3839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626540
76	NC_016022	CAT	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
77	NC_016022	TGC	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
78	NC_016022	ATCT	2	8	3968	3975	25 %	50 %	0 %	25 %	347626540
79	NC_016022	CAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
80	NC_016022	TCG	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
81	NC_016022	GAC	2	6	4013	4018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626540
82	NC_016022	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626540
83	NC_016022	CGAA	2	8	4134	4141	50 %	0 %	25 %	25 %	347626540
84	NC_016022	ATCC	2	8	4211	4218	25 %	25 %	0 %	50 %	347626540
85	NC_016022	AAG	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347626540
86	NC_016022	ATC	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
87	NC_016022	CGG	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
88	NC_016022	GCGG	2	8	4333	4340	0 %	0 %	75 %	25 %	347626540
89	NC_016022	ATCGGC	2	12	4366	4377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347626540
90	NC_016022	CAT	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
91	NC_016022	TGG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347626540
92	NC_016022	TGA	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626540
93	NC_016022	TCG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
94	NC_016022	CG	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	347626540
95	NC_016022	AGCGA	2	10	4648	4657	40 %	0 %	40 %	20 %	347626540
96	NC_016022	GC	4	8	4695	4702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016022	GCG	2	6	4706	4711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016022	GT	3	6	4714	4719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016022	ACC	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.